lammps安装编译

本所有编译都是在/OPT下面编译，共享目录
1.下载fftw http://www.fftw.org/fftw-3.3.8.tar.gz
2.下载mpich http://www.mpich.org/static/downloads/3.3.2/mpich-3.3.2.tar.gz
3.下载lammps 选择第一个稳定版下载 https://lammps.sandia.gov/download.html

4.编译fftw

cd /opt

mkdir fftw3.3.8

wget http://www.fftw.org/fftw-3.3.8.tar.gz

tar -xvf fftw-3.3.8.tar.gz

cd fftw-3.3.8/

./configure --prefix=/opt/fftw3.3.8 --enable-shared=yes

make -j 4 && make install

5.编译mpich

cd /opt

mkdir mpich3.3.2

wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.3.2/mpich-3.3.2.tar.gz

cd mpich-3.3.2

./configure --prefix=/opt/mpich3.3.2

make -j 4 && make install

6.编译lammps
将下载好的lammps解压，进入文件内

cd /opt/lammps-3Mar20/src/MAKE

vim Makefile.mpi

将下面一行注释，如图

LMP_INC = -DLAMMPS_GZIP -DLAMMPS_MEMALIGN=64 # -DLAMMPS_CXX98

修改保存退出

cd …/src

加入模块

make package-status //查看lammps可用模块

make yes-all

make no-lib

make no-ext

make -j 4 mpi

环境变量
export PATH=/opt/mpich3.3.2/bin:/opt/fftw3.3.8/bin:/opt/lammps-3Mar20/src:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/fftw3.3.8/lib:/opt/mpich3.3.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH
以上就全部编译完成
------分割--------
然后进入算例mpirun -np 8 lmp_mpi < in.friction
算例正常运行
如果需要安装gpu版
cd /opt/lammps-3Mar20/lib/gpu
vim Makefile.linux
CUDA_HOME=/usr/local/cuda-11.1
下面参数修改请看**CUDA**维基百科

Turing hardware

CUDA_ARCH = -arch=sm_75
修改完成保存退出
make -f Makefile.linux
cd /opt/lammps-3Mar20/src
make yes-gpu
make -j mpi
计算12核加gpu
mpirun -np 12 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 -in in.friction

关于编译lammps+plumed
需下载lammps-stable_7Aug2019的版本
cd src
make lib-plumed args=“-b”
make yes-all
make no-lib
make no-ext
make yes-plumed或make yes-user-plumed
make -j 8 mpi